Caracterización de la diversidad genética de variedades nativas de cacao mediante marcadores moleculares SSR
Palabras clave:
diversidad genética, germoplasma, marcadores moleculares, microsatélites, SSR, Theobroma cacao L.Resumen
La conservación y caracterización de la diversidad genética del cacao (Theobroma cacao L.) constituyen aspectos fundamentales para el aprovechamiento sostenible de los recursos fitogenéticos, la identificación de materiales con características agronómicas diferenciadas y el fortalecimiento de los programas de mejoramiento genético. Los marcadores moleculares de secuencias simples repetidas (SSR) representan herramientas ampliamente utilizadas para determinar niveles de variabilidad, relaciones genéticas y estructura poblacional debido a su elevado polimorfismo, codominancia y reproducibilidad. El objetivo de la investigación fue caracterizar la diversidad genética de variedades nativas de cacao mediante marcadores moleculares SSR y determinar las relaciones de similitud y diferenciación existentes entre los materiales evaluados. Se analizaron 72 accesiones nativas de cacao procedentes de seis zonas productoras, utilizando un panel de 15 loci microsatélites. La extracción del ADN genómico se realizó a partir de hojas jóvenes mediante un protocolo CTAB modificado, seguida por amplificación mediante reacción en cadena de la polimerasa y separación de los productos amplificados. Se determinaron el número de alelos, contenido de información polimórfica, heterocigosidad observada y esperada, índice de diversidad genética y coeficiente de endogamia. La estructura genética fue evaluada mediante análisis de coordenadas principales, agrupamiento basado en distancias genéticas y análisis bayesiano. Los 15 loci SSR generaron 142 alelos, con un promedio de 9,47 alelos por locus. La heterocigosidad observada promedio fue de 0,63, mientras que la heterocigosidad esperada alcanzó 0,71. El contenido de información polimórfica presentó un promedio de 0,68, demostrando la elevada capacidad discriminante de los marcadores seleccionados. El análisis molecular de varianza indicó que el 76 % de la variabilidad genética se concentró dentro de las poblaciones y el 24 % entre ellas. El análisis de estructura identificó cuatro grupos genéticos principales con diferentes niveles de mezcla ancestral. Se concluye que las variedades nativas evaluadas mantienen una elevada diversidad genética y constituyen recursos estratégicos para la conservación, selección de genotipos y desarrollo de programas de mejoramiento del cacao.
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